Nació en Bilbao. Licenciado en la Facultad de Medicina de Barcelona, con premio extraordinario. Interno por oposición y preparador anatómico de la facultad, fue compañero y amigo de Joaquín Albarrán durante la carrera, decidiéndose por la Urología, influenciado por éste, y asistiendo muchas veces al Hospital Necker. A su vez, Azcarreta correspondía e invitaría al maestro hispano-cubano en repetidas ocasiones a su Clínica Urológica privada, de la calle de la Bonanova, en Barcelona.

Introductor en España del cistoscopio, del cateterismo ureteral y de los Rayos X en Urología. Fundador de la Revista Quirúrgica de las Enfermedades de las Vías Urinarias (Barcelona 1889) y no de los pocos urólogos españoles que, por méritos propios y en su época, fue miembro de la Asociación Francesa de Urología. Gran publicista y divulgador, su Clínica siempre estuvo muy concurrida, dando conferencias sobre la moderna urología y en particular sobre la tuberculosis renal, tema sobre el que escribió varias obras. Maestro de una pléyade de buenos especialistas, entre ellos Emilio Sacanella.